53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2068 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2068  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  164  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254779  normal  0.0154209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  76.36 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  56.36 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  65.45 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  54.55 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  45.07 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1773  protein of unknown function DUF433  56.14 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  49.18 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  56 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  48.98 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  58 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2054  protein of unknown function DUF433  45.45 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0894  protein of unknown function DUF433  47.54 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  45.9 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  45.9 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2505  hypothetical protein  44.07 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  49.09 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5015  hypothetical protein  54.72 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1160  hypothetical protein  51.02 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  50.91 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  53.06 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2090  protein of unknown function DUF433  42.25 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  54.55 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  42.19 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2760  hypothetical protein  59.46 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.986654  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  40.62 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  51.02 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  51.02 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  48.98 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0264  protein of unknown function DUF433  56.1 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.281649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  50.94 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1367  hypothetical protein  57.78 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.883887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3038  hypothetical protein  44.9 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  51.02 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  56.82 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3010  hypothetical protein  41.67 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3242  protein of unknown function DUF433  40.82 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0712  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10879  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2876  protein of unknown function DUF433  40.82 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0601  hypothetical protein  55.56 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.179543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0946  hypothetical protein  46.67 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  52.27 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4630  protein of unknown function DUF433  50 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.569731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  44 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1355  protein of unknown function DUF433  44.9 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3854  protein of unknown function DUF433  46.15 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.949031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2639  protein of unknown function DUF433  48.89 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0907931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1887  protein of unknown function DUF433  40.91 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4167  hypothetical protein  51.16 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338613  decreased coverage  0.00000145302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  52.27 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>