93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0082 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  80.56 
 
 		 76 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  80.56 
 
 		 74 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  80.56 
 
 		 74 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  76.39 
 
 		 74 aa  114  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  68.06 
 
 		 74 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  70.59 
 
 		 76 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5015  hypothetical protein  70.59 
 
 		 74 aa  100  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819476  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0894  protein of unknown function DUF433  61.97 
 
 		 73 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2090  protein of unknown function DUF433  67.69 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  61.43 
 
 		 78 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0946  hypothetical protein  63.77 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1911  protein of unknown function DUF433  74 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4961  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0601  hypothetical protein  61.4 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.179543 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  46.77 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  50.77 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3242  protein of unknown function DUF433  50.85 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3038  hypothetical protein  50.85 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  52.63 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2876  protein of unknown function DUF433  50.85 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2054  protein of unknown function DUF433  48.57 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  45.31 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  45.31 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  45.31 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4630  protein of unknown function DUF433  57.89 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.569731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  47.83 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0538  hypothetical protein  55.36 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1160  hypothetical protein  48.28 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  48.53 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1355  protein of unknown function DUF433  51.79 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1367  hypothetical protein  50.88 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.883887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4619  protein of unknown function DUF433  48.28 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  50.88 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  47.06 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  51.72 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  51.72 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1772  hypothetical protein  44.83 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.5052  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0896  hypothetical protein  53.57 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000110923 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  52.63 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4167  hypothetical protein  48.21 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338613  decreased coverage  0.00000145302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3561  protein of unknown function DUF433  39.68 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0506112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  50 
 
 		 82 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  39.68 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  43.86 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  49.12 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2760  hypothetical protein  48.08 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.986654  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  45.9 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  47.54 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2499  hypothetical protein  46.55 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322714  normal  0.339788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2639  protein of unknown function DUF433  49.18 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0907931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0712  hypothetical protein  45.9 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10879  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1377  hypothetical protein  49.12 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3854  protein of unknown function DUF433  49.12 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.949031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  47.37 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2261  hypothetical protein  43.86 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3629  hypothetical protein  56.25 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  51.79 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  41.54 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1887  protein of unknown function DUF433  36.62 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1773  protein of unknown function DUF433  43.08 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  44.62 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1312  hypothetical protein  49.06 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2068  hypothetical protein  42.19 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254779  normal  0.0154209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  46.27 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4387  protein of unknown function DUF433  57.14 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0716835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5531  protein of unknown function DUF433  48.98 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2776  hypothetical protein  43.86 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0264  protein of unknown function DUF433  54.17 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.281649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  40.68 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  44.26 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1154  protein of unknown function DUF433  42.55 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  38.71 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  36.07 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2492  hypothetical protein  38.6 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000948417  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  40.85 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0673  hypothetical protein  40.35 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1362  protein of unknown function DUF433  30 
 
 		 199 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2505  hypothetical protein  40.32 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  36.92 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0674  hypothetical protein  34.92 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490782  normal  0.33948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1636  hypothetical protein  36.84 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0516915  decreased coverage  0.000426709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0293  protein of unknown function DUF433  44.23 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5692  protein of unknown function DUF433  33.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0280  protein of unknown function DUF433  46.15 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.850652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  32.81 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3849  protein of unknown function DUF433  47.83 
 
 		 201 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3010  hypothetical protein  55.88 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3520  hypothetical protein  55.88 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1332  hypothetical protein  47.62 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2498  hypothetical protein  36.84 
 
 		 72 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.799873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>