80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2499 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2499  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322714  normal  0.339788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3561  protein of unknown function DUF433  47.14 
 
 		 76 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0506112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1772  hypothetical protein  43.28 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.5052  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0896  hypothetical protein  48.28 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000110923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0538  hypothetical protein  39.13 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1355  protein of unknown function DUF433  43.94 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  40.58 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5531  protein of unknown function DUF433  43.48 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4619  protein of unknown function DUF433  35.82 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4167  hypothetical protein  37.31 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338613  decreased coverage  0.00000145302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  47.54 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  47.54 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  49.12 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1154  protein of unknown function DUF433  34.78 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2090  protein of unknown function DUF433  49.15 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  38.81 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  48.28 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  40.58 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1377  hypothetical protein  37.68 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  47.37 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  44.83 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2505  hypothetical protein  42.62 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5015  hypothetical protein  42.62 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819476  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0601  hypothetical protein  39.71 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.179543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1773  protein of unknown function DUF433  43.1 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  36.36 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1160  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  46.55 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  43.28 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  43.55 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  43.55 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2776  hypothetical protein  44.12 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  42.62 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  41.79 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3242  protein of unknown function DUF433  43.75 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4630  protein of unknown function DUF433  43.1 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.569731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2876  protein of unknown function DUF433  44.44 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  43.86 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1367  hypothetical protein  40.91 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.883887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  44.93 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3038  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  36.99 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  38.57 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  39.71 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  44.07 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  31.43 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1887  protein of unknown function DUF433  30.16 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0946  hypothetical protein  44.83 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0712  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10879  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0894  protein of unknown function DUF433  43.1 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  34.33 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3629  hypothetical protein  48.94 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0264  protein of unknown function DUF433  44.93 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.281649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2760  hypothetical protein  48 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.986654  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2054  protein of unknown function DUF433  43.86 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  39.66 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2492  hypothetical protein  43.1 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000948417  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  43.1 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  28.17 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1636  hypothetical protein  41.38 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0516915  decreased coverage  0.000426709 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1312  hypothetical protein  40.38 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4550  protein of unknown function DUF433  38.89 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.266998  normal  0.934989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  39.66 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  41.07 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  39.66 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4945  protein of unknown function DUF433  39.06 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0459524  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  32.84 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0293  protein of unknown function DUF433  40 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0673  hypothetical protein  32.14 
 
 		 78 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2639  protein of unknown function DUF433  38.6 
 
 		 69 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0907931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0674  hypothetical protein  33.87 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490782  normal  0.33948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0280  protein of unknown function DUF433  45.1 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.850652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  33.33 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0523  protein of unknown function DUF433  34.55 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0117075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  37.93 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0386  hypothetical protein  40.82 
 
 		 79 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>