98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0439 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  251  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1160  hypothetical protein  72.86 
 
 
74 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295531  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2054  protein of unknown function DUF433  59.72 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  55.17 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1772  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.5052  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  53.33 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5015  hypothetical protein  51.43 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1887  protein of unknown function DUF433  46.27 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0712  hypothetical protein  53.23 
 
 
77 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10879  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4167  hypothetical protein  48.53 
 
 
81 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338613  decreased coverage  0.00000145302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0538  hypothetical protein  46.88 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  45.33 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  52.38 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  51.72 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  49.21 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  51.72 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  51.72 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5531  protein of unknown function DUF433  43.08 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  47.62 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  49.21 
 
 
76 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  51.72 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  50.77 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  53.45 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1367  hypothetical protein  50.85 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.883887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2639  protein of unknown function DUF433  50 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0907931  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  50.85 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  49.21 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  49.18 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  47.83 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  44.12 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2261  hypothetical protein  41.79 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4619  protein of unknown function DUF433  46.88 
 
 
81 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2090  protein of unknown function DUF433  47.62 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  43.48 
 
 
73 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4961  hypothetical protein  47.37 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  46.77 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0896  hypothetical protein  43.75 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000110923 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1377  hypothetical protein  40.58 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4630  protein of unknown function DUF433  46.77 
 
 
78 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.569731  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3561  protein of unknown function DUF433  36.11 
 
 
76 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0506112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0293  protein of unknown function DUF433  48.15 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1773  protein of unknown function DUF433  50 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537848  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  44.26 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0601  hypothetical protein  46.03 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.179543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0894  protein of unknown function DUF433  46.38 
 
 
73 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3038  hypothetical protein  43.84 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  46.55 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1355  protein of unknown function DUF433  44.26 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  42.25 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  42.25 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1312  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2760  hypothetical protein  45.28 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.986654  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  43.66 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  47.62 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0280  protein of unknown function DUF433  53.19 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.850652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  42.25 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  40.32 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  38.57 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0673  hypothetical protein  41.67 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  40.35 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  40.35 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2499  hypothetical protein  38.81 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322714  normal  0.339788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2876  protein of unknown function DUF433  39.39 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0127406  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1154  protein of unknown function DUF433  34.67 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2505  hypothetical protein  41.27 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3854  protein of unknown function DUF433  42.62 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.949031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  44.83 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3242  protein of unknown function DUF433  39.39 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4550  protein of unknown function DUF433  43.33 
 
 
79 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.266998  normal  0.934989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3629  hypothetical protein  49.06 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5692  protein of unknown function DUF433  36.51 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  38.75 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0264  protein of unknown function DUF433  38.67 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.281649  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  36.62 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0946  hypothetical protein  44.07 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  33.82 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2068  hypothetical protein  54.55 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254779  normal  0.0154209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2498  hypothetical protein  40.62 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.799873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  46.94 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  36.61 
 
 
217 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2776  hypothetical protein  38.24 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  37.1 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  37.1 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3849  protein of unknown function DUF433  39.02 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4858  hypothetical protein  43.86 
 
 
220 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332293  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4945  protein of unknown function DUF433  36.07 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0459524  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2492  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000948417  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4520  protein of unknown function DUF433  32.84 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000972805  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1636  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0516915  decreased coverage  0.000426709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4387  protein of unknown function DUF433  44.23 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0716835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1362  protein of unknown function DUF433  32.89 
 
 
199 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0386  hypothetical protein  48.98 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0655  hypothetical protein  35.85 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.418229  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1911  protein of unknown function DUF433  42.31 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6321  hypothetical protein  48.98 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3639  hypothetical protein  48.72 
 
 
49 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0282  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>