29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4858 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4858  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  30.96 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5918  protein of unknown function DUF433  40.35 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3251  protein of unknown function DUF433  30.54 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5509  protein of unknown function DUF433  23.88 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0404309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  46.3 
 
 		 73 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  43.86 
 
 		 127 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  41.82 
 
 		 76 aa  48.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2498  hypothetical protein  39.62 
 
 		 72 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.799873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  40.35 
 
 		 81 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  43.4 
 
 		 73 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  32.86 
 
 		 95 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  33.33 
 
 		 94 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  41.38 
 
 		 75 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  41.38 
 
 		 75 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5692  protein of unknown function DUF433  41.67 
 
 		 86 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4550  protein of unknown function DUF433  42.59 
 
 		 79 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.266998  normal  0.934989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  36.84 
 
 		 76 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  32.91 
 
 		 82 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  37.29 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  38.6 
 
 		 80 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  36.84 
 
 		 82 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3849  protein of unknown function DUF433  27.75 
 
 		 201 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  36.21 
 
 		 78 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2261  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  42  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  36.21 
 
 		 73 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2019  hypothetical protein  31.94 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0813587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>