22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0655 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0655  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  144  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.418229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0673  hypothetical protein  65 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5692  protein of unknown function DUF433  53.03 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  57.89 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  57.89 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2498  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.799873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4945  protein of unknown function DUF433  44.26 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0459524  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4550  protein of unknown function DUF433  43.55 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.266998  normal  0.934989 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1772  hypothetical protein  30.99 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.5052  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  35.85 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4961  hypothetical protein  32.73 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1154  protein of unknown function DUF433  32.2 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0280  protein of unknown function DUF433  35.42 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.850652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  34 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  36.17 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5509  protein of unknown function DUF433  42.11 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0404309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0282  hypothetical protein  34.04 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  26.15 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  30.65 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  30.65 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3561  protein of unknown function DUF433  30.77 
 
 		 76 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0506112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  35.09 
 
 		 74 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>