22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5509 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5509  protein of unknown function DUF433  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0404309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  29.36 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4858  hypothetical protein  23.88 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2019  hypothetical protein  31.58 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0813587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3251  protein of unknown function DUF433  32 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5918  protein of unknown function DUF433  35.48 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1362  protein of unknown function DUF433  36.47 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0674  hypothetical protein  34.78 
 
 		 105 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490782  normal  0.33948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  39.34 
 
 		 95 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  39.34 
 
 		 94 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0673  hypothetical protein  43.59 
 
 		 78 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4945  protein of unknown function DUF433  52.63 
 
 		 88 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0459524  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2498  hypothetical protein  39.13 
 
 		 72 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.799873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3849  protein of unknown function DUF433  39.19 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  48.72 
 
 		 82 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1887  protein of unknown function DUF433  46.15 
 
 		 83 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  45.1 
 
 		 76 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4550  protein of unknown function DUF433  45.65 
 
 		 79 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.266998  normal  0.934989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  44.44 
 
 		 77 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  48.72 
 
 		 73 aa  41.6  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  47.37 
 
 		 76 aa  41.6  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0293  protein of unknown function DUF433  43.59 
 
 		 78 aa  41.2  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>