84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1238 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  145  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  50.68 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  54.55 
 
 
81 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  57.58 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1773  protein of unknown function DUF433  57.97 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537848  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  54.55 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  49.28 
 
 
73 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2505  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  51.52 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  52.17 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2054  protein of unknown function DUF433  52.24 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0538  hypothetical protein  55.74 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  52.54 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  53.03 
 
 
73 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  47.89 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  53.23 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0896  hypothetical protein  54.1 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000110923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2760  hypothetical protein  57.41 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.986654  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1160  hypothetical protein  50.85 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  54.39 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0894  protein of unknown function DUF433  50.79 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  47.62 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  54.24 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4630  protein of unknown function DUF433  50 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.569731  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  55.93 
 
 
74 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  55.93 
 
 
74 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  55.93 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3038  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58349  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0601  hypothetical protein  50.77 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.179543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3242  protein of unknown function DUF433  51.67 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2090  protein of unknown function DUF433  50.79 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  46.48 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4619  protein of unknown function DUF433  47.54 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2876  protein of unknown function DUF433  50 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0127406  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1367  hypothetical protein  44.93 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.883887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  53.57 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1772  hypothetical protein  41.94 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.5052  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3854  protein of unknown function DUF433  44.93 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.949031 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0264  protein of unknown function DUF433  51.43 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.281649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2639  protein of unknown function DUF433  49.21 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0907931  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  50.85 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  48.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  44.93 
 
 
78 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5015  hypothetical protein  48.28 
 
 
74 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  53.85 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  51.79 
 
 
76 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  53.57 
 
 
76 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4167  hypothetical protein  49.18 
 
 
81 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338613  decreased coverage  0.00000145302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  43.48 
 
 
78 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  48.39 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3561  protein of unknown function DUF433  41.94 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0506112 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  48.39 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2261  hypothetical protein  45.9 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  37.29 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2492  hypothetical protein  43.28 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000948417  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2499  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322714  normal  0.339788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  43.48 
 
 
82 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1355  protein of unknown function DUF433  44.29 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  46.77 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0946  hypothetical protein  47.54 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  47.27 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1377  hypothetical protein  47.54 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3761  hypothetical protein  42.62 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000832493  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5531  protein of unknown function DUF433  44.12 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2776  hypothetical protein  38.24 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1312  hypothetical protein  50.91 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2068  hypothetical protein  50.94 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254779  normal  0.0154209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1636  hypothetical protein  43.28 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0516915  decreased coverage  0.000426709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4961  hypothetical protein  46.43 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0712  hypothetical protein  46.88 
 
 
77 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10879  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  45.76 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  45.21 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5308  protein of unknown function DUF433  40.3 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  36.11 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  36.11 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0293  protein of unknown function DUF433  49.06 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3629  hypothetical protein  48.98 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3904  protein of unknown function DUF433  37.31 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4550  protein of unknown function DUF433  41.67 
 
 
79 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.266998  normal  0.934989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4387  protein of unknown function DUF433  47.37 
 
 
73 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0716835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1362  protein of unknown function DUF433  40.32 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2019  hypothetical protein  42.55 
 
 
216 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0813587  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0674  hypothetical protein  40.68 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490782  normal  0.33948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>