19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3761 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3761  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000832493  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5308  protein of unknown function DUF433  66.36 
 
 
108 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3904  protein of unknown function DUF433  55.14 
 
 
109 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2357  hypothetical protein  59.77 
 
 
124 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.263343  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0674  hypothetical protein  39.8 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490782  normal  0.33948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1362  protein of unknown function DUF433  45.83 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  41.67 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  42.62 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  37.5 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  48.72 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  34.92 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5918  protein of unknown function DUF433  33.87 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2019  hypothetical protein  39.29 
 
 
216 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0813587  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  39.13 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  41.07 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1773  protein of unknown function DUF433  34.78 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537848  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  36.21 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  34.43 
 
 
82 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>