30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4520 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4520  protein of unknown function DUF433  100 
 
 
97 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000972805  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4592  hypothetical protein  43.33 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  40.62 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2750  hypothetical protein  40.58 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0523  protein of unknown function DUF433  44.64 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0117075  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2544  protein of unknown function DUF433  33.77 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1142  protein of unknown function DUF433  43.08 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4930  protein of unknown function DUF433  35.21 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269597  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3904  protein of unknown function DUF433  33.75 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  32.84 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4377  protein of unknown function DUF433  36.84 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  unclonable  0.00000000140954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1887  protein of unknown function DUF433  33.82 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4315  protein of unknown function DUF433  37.7 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3570  hypothetical protein  27.54 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  37.5 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2581  hypothetical protein  29.09 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3525  hypothetical protein  29.09 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  30.91 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1332  hypothetical protein  37.04 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2054  protein of unknown function DUF433  35.42 
 
 
75 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0262  hypothetical protein  32.88 
 
 
108 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  33.87 
 
 
82 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  34.48 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  38.1 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  33.87 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  34.38 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2014  protein of unknown function DUF433  36.36 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  32.31 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5509  protein of unknown function DUF433  43.59 
 
 
210 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0404309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1362  protein of unknown function DUF433  29.73 
 
 
199 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>