16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2750 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2750  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  222  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3570  hypothetical protein  39.44 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1332  hypothetical protein  35.8 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3127  hypothetical protein  37.93 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343078  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4543  hypothetical protein  32.94 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.797661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4520  protein of unknown function DUF433  40.58 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000972805  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2581  hypothetical protein  48.08 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3525  hypothetical protein  48.08 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0262  hypothetical protein  37.93 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0171  hypothetical protein  36.23 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00303603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3594  hypothetical protein  32.73 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2520  hypothetical protein  32.73 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0362222  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4592  hypothetical protein  32.81 
 
 
95 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4930  protein of unknown function DUF433  43.1 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269597  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4377  protein of unknown function DUF433  30.49 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  unclonable  0.00000000140954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4315  protein of unknown function DUF433  30.49 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>