15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3849 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3849  protein of unknown function DUF433  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9106  hypothetical protein  29.19 
 
 		 217 aa  92.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2019  hypothetical protein  30.32 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0813587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  48.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  39.02 
 
 		 127 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  52.17 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  52.17 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  47.06 
 
 		 74 aa  44.7  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  47.92 
 
 		 76 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4961  hypothetical protein  51.11 
 
 		 76 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  44.64 
 
 		 88 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5509  protein of unknown function DUF433  42.11 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0404309 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4858  hypothetical protein  27.75 
 
 		 220 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.024664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>