70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1741 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  75.63 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  75.38 
 
 		 193 aa  286  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  69.35 
 
 		 197 aa  271  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  75.98 
 
 		 195 aa  270  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  79.1 
 
 		 194 aa  269  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  68.47 
 
 		 198 aa  269  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  67.65 
 
 		 199 aa  265  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  75.14 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  67.68 
 
 		 203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  72.62 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  70.06 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  64.18 
 
 		 198 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  68.6 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  65.24 
 
 		 190 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  63.04 
 
 		 183 aa  228  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  63.39 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  66.48 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  63.13 
 
 		 264 aa  225  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  63.54 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 204 aa  220  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  66.05 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  65.45 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  63.39 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  62.72 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  71.83 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  66.9 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  61.76 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  65.31 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  63.38 
 
 		 169 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  46.71 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  35.34 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 377 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  30.48 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  36.14 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  33.02 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  31.17 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  31.17 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0045  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 146 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  29.58 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  32.84 
 
 		 314 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  28.89 
 
 		 132 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.33 
 
 		 154 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  34.38 
 
 		 315 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 158 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 138 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 253 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 132 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>