73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3143 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  34.12 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  34.94 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 212 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  37.8 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 208 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 195 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  36.14 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  32.94 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  32.94 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0132  MerR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  31.76 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  32.94 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  34.72 
 
 		 225 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  30.59 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 251 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  30.23 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0842  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.399496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4201  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2866  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  35.71 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  37.25 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1554  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 122 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.890777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  35.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 135 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2291  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 135 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 		 152 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 135 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 135 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  37.25 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0876  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2201  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.47 
 
 		 277 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  37.25 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  37.25 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>