More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2201 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0876  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2201  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2291  MerR family transcriptional regulator  93.65 
 
 		 126 aa  237  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2866  MerR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1554  MerR family transcriptional regulator  68.38 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.890777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0842  transcriptional regulator  68.64 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.399496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2968  MerR family transcriptional regulator  68.33 
 
 		 121 aa  161  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151123  normal  0.0469101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2292  MerR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2969  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0979935  normal  0.0797223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0840  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.413569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0875  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2200  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515575  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2867  MerR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3252  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106393  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1556  MerR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.659749  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0181  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0464  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4252  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285942  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  41.23 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4442  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0537  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.400616  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  31.62 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  33.04 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4201  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  35.19 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4735  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2034  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327556  normal  0.554633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2569  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1459  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.425414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  37.39 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  28.93 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  32.8 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0280  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0843024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  31.15 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3653  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0138  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0130  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  29.91 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38430  regulatory gene of gnyRDBHAL cluster, GnyR  33.33 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  30.91 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0091  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0453  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3273  regulatory protein GnyR  33.33 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2235  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3539  transcriptional regulator, putative  33.91 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2385  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2924  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0132  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  34.17 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2068  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2820  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1034  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2472  regulatory protein, MerR  33.07 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4372  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3843  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1944  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0920422  hitchhiker  0.000346668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1865  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.0420495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1259  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2617  transcriptional regulator MerR family  31.67 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4192  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2743  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3780  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3058  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  34.56 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2012  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2106  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_004310  BR1179  transcriptional regulator, putative  27.5 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0654796  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1138  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0775517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>