77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2099 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  81.72 
 
 		 243 aa  295  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  82.05 
 
 		 194 aa  289  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  75.38 
 
 		 198 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  79.55 
 
 		 198 aa  284  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  74.24 
 
 		 199 aa  281  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  79.31 
 
 		 197 aa  280  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  75 
 
 		 195 aa  275  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  79.04 
 
 		 200 aa  263  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  76.14 
 
 		 194 aa  262  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  73.6 
 
 		 203 aa  254  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  82.89 
 
 		 187 aa  249  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  72.73 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  70.62 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  69.23 
 
 		 190 aa  244  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  76.73 
 
 		 206 aa  244  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  67.78 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  65.57 
 
 		 189 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 206 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 206 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  71.26 
 
 		 205 aa  234  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 207 aa  233  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  69.64 
 
 		 208 aa  232  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  67.44 
 
 		 225 aa  231  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  65.36 
 
 		 264 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  65.41 
 
 		 183 aa  229  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  68.86 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  68.89 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 186 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  63.69 
 
 		 197 aa  204  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  69.5 
 
 		 188 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  61.44 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  46.94 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  39.51 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  35.34 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  29.52 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 148 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  36.14 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 		 143 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 260 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 132 aa  44.7  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  31.19 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  34.78 
 
 		 136 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0045  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  33.8 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 136 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 136 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 253 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 136 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0091  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 138 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 128 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  39.24 
 
 		 319 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  34.74 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>