More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1572 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  47.29 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  44.85 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  43.7 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  44.74 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  41.23 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  43.75 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  52 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  55.71 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  50 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  55.74 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  45.68 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  46.38 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  41.84 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0951  glutamine synthetase repressor  36.19 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  52.24 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  36.84 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  43.08 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0539  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  36.62 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  40.3 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  35.21 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  52.83 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  37.68 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  40 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  35.37 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 319 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  44.26 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  36.99 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 242 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  38.03 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  39.08 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  41.54 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>