132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0716 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0951  glutamine synthetase repressor  50.89 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394766  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  53.1 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  52.68 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  53.21 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  42.11 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  48.72 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  40.22 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  40.7 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  35.29 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  33.8 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 304 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  31.46 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  39.06 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  33.66 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  34.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 251 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 308 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 319 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2183  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 268 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000038716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  36.26 
 
 		 251 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2524  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 298 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0506467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  44.23 
 
 		 141 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 140 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 141 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 155 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 239 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0539  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 111 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 140 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 131 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  28.12 
 
 		 253 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.68 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>