More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2835 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  92.78 
 
 		 97 aa  184  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  56.79 
 
 		 242 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  50.59 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 243 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 289 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  50.59 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  47.13 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  44.83 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  45.98 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  48.81 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  49.43 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  45.16 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  46.99 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  47.13 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  44.94 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  45.35 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  48.28 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  55.07 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  45.24 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  48.19 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 205 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  45.78 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  47.13 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 156 aa  76.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  45.98 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  40.23 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  45.78 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  47.95 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  48.28 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  42.53 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  41 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  42.05 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  42.22 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  49.28 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  51.56 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  40.96 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  45.74 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  45.78 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  40.7 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  47.06 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  47.06 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  45.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  45.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  45.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  45.59 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 243 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  37.65 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  40.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  40.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  40.54 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  40.54 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  40.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>