More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0975 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
130 aa  265  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  67.01 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  53.45 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  43.86 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  55.42 
 
 
125 aa  102  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  42.45 
 
 
124 aa  100  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  40.83 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
124 aa  97.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  53.01 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  47.78 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
243 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 
242 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
289 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  51.76 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
97 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  44.32 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  42.39 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  35.97 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  45.57 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  46.15 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  45.88 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  50.7 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  41.3 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  36.67 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  41.98 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  34.48 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  41.57 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  38.2 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  35.42 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  38.55 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  49.32 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  35.79 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  41.67 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  45.45 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.04 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  34.94 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  37.11 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  37.11 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  37.11 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  37.11 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  36.96 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  37.11 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  35.8 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  44.29 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
243 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>