More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1310 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  53.27 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  53.1 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  51.82 
 
 		 140 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  51.4 
 
 		 156 aa  108  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  53.68 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  42.47 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 		 152 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  43.88 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  56.82 
 
 		 156 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  49.17 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  49.52 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  56.98 
 
 		 115 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  54.35 
 
 		 115 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  43.41 
 
 		 132 aa  99.4  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 205 aa  99  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  97.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  50.93 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  52.75 
 
 		 156 aa  95.5  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  51.65 
 
 		 143 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  43.36 
 
 		 126 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 129 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 129 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 129 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  44.54 
 
 		 144 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 169 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  42.52 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 124 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 120 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  50.96 
 
 		 152 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  49.11 
 
 		 144 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  49.32 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  50.67 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  46.05 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  46.05 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  46.74 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  40.62 
 
 		 123 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  44.57 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  51.39 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  47.95 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 98 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  43.53 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 292 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 145 aa  62  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  36.67 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  37.18 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  33.65 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  33.65 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  33.65 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  33.65 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  39.44 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  38.3 
 
 		 276 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  40.96 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  39.44 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 108 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 319 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>