274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6946 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 143 aa  291  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  78.1 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 201 aa  173  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  62.24 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  67.67 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  59.54 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  58.74 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  56.34 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 205 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  54.61 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  54.96 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  56.74 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  70.65 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  76.19 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  73.26 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  52.59 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  65.93 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  47.59 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  47.76 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  43.15 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  48.2 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 243 aa  97.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  51.65 
 
 		 195 aa  97.4  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  45.87 
 
 		 242 aa  96.7  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  52.08 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 180 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 289 aa  95.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  47.96 
 
 		 198 aa  93.2  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  59.77 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  37.72 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  46 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  47.78 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  37.14 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  52.87 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  41.84 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  38.06 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  36.84 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  42.27 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  34.45 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  39.08 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  38.2 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  36.26 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  44.44 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  37.63 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  36.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  37.08 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 273 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 269 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  32.22 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>