More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0787 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 243 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  54.31 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  54 
 
 		 289 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 201 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  53.76 
 
 		 242 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 169 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  56.18 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  55.1 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 205 aa  97.1  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  51.46 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  52.81 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 161 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  57.89 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  47.52 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  47.01 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  39.2 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  48.39 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  50 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  49.37 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  43.82 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  40.66 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  42.68 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  46.32 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  44.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  36.28 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  48.72 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  41.76 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  40.62 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  47.19 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  43.53 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  44.71 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  45.22 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  48.15 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  38.3 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  42.39 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 292 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2509  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2140  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 273 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  32.61 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 283 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  30.3 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  32.63 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 193 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  32.84 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>