More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2140 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2140  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2509  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5725  transcriptional regulator, MerR family  35.33 
 
 		 219 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.747282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  29.71 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.11 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  33.1 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  31.69 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  32.28 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  32.28 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  28.87 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  32.28 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 215 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  28.78 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  29.25 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.21 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.21 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.21 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  42.65 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  52.73 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.5 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  30.37 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  41.27 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  30.37 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  31.63 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  29.31 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  39.13 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>