More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2116 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 133 aa  267  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  86.57 
 
 		 134 aa  231  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  66.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  52 
 
 		 123 aa  129  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  53.6 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  52.17 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  43.7 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  43.51 
 
 		 121 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  42.97 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  44.35 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  56.25 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0951  glutamine synthetase repressor  31.67 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  44.16 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  35.63 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  40.48 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  43.66 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 242 aa  66.6  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  43.9 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  38.55 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  41.56 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  41.89 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  42.47 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  35.53 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  37.19 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  44.78 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  38.46 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  39.19 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  40.85 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  40.28 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  40.28 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  40.85 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  40.85 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  40.85 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  41.89 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  36.45 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  41.67 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>