More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3449 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
98 aa  193  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  56.96 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  52.63 
 
 
96 aa  90.1  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  52.56 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  57.14 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  62.5 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  55.71 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  51.9 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
205 aa  77  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  43.82 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  45.56 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  49.41 
 
 
242 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
289 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  40.45 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  64.15 
 
 
60 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  42.7 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  48.05 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  40.96 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  40.45 
 
 
195 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  44.44 
 
 
147 aa  66.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  43.21 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  42.68 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  43.75 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  42.35 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  47.95 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
169 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  40.82 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  40.4 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  45.45 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  37.74 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  39.18 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  40.4 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  39.18 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  39.18 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  44.59 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  39.47 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  39.74 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
276 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  42.5 
 
 
327 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  41.77 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
302 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 
269 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  42.68 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  34.48 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 
269 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 
180 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
298 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
319 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
340 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
351 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>