96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3601 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 122 aa  236  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  56.86 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  58.89 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  50.94 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  54.84 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  55.29 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  46.74 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  47.87 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  45.05 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  40.4 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  38.95 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  31 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  40.82 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1003  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  35.42 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  43.04 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4130  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.442587  normal  0.0543283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  37.08 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  32.84 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  38.2 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3929  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  40.66 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4594  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608405 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  33.33 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5536  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3620  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.065575  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4747  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  32.32 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  33 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  34.74 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  37.66 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  35.05 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  32.63 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  28.71 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  35.06 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  39.02 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  27.88 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  39.24 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  27.88 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  39.51 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  38 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  37.93 
 
 		 229 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 123 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 157 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 98 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  39.29 
 
 		 229 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  24.21 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 389 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  39.53 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  39.53 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 319 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  39.53 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  39.53 
 
 		 222 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 351 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 351 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>