More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0495 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
124 aa  249  7e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  98.39 
 
 
124 aa  244  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  97.58 
 
 
124 aa  244  4e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  77.24 
 
 
124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  73.98 
 
 
125 aa  189  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  75 
 
 
123 aa  181  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  68.85 
 
 
125 aa  176  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  67.21 
 
 
124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  63.93 
 
 
124 aa  169  9e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  61.6 
 
 
125 aa  155  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  56.52 
 
 
140 aa  117  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  52.87 
 
 
242 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
243 aa  105  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 
131 aa  104  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  49.47 
 
 
289 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
130 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  47.06 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  46.94 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  49.48 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  49.4 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
201 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  45.74 
 
 
102 aa  90.1  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  50.57 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  48.91 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  42.5 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  47.13 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
97 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  49.4 
 
 
161 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  46.24 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  36.97 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  57.53 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  45.98 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
205 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  42.53 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  40 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  41.76 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  41.76 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  51.32 
 
 
198 aa  77  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  35.38 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  46.74 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  37.11 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  34.48 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  43.18 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  42.17 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
166 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
166 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  42.47 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
292 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
60 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  37.23 
 
 
151 aa  57  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
188 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>