224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0844 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 113 aa  221  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  66.33 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  46.39 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  44.68 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  46.91 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  38.2 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  40.4 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  41.05 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  43.14 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  44.58 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  31.96 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  36.17 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  42.5 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  41.41 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  40.37 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  37.93 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  39.77 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  37.08 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  37.23 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  39.76 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  37.84 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  29.79 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  34.88 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  37.08 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  34.04 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  31.31 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  39.76 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 333 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 289 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0051  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  26.67 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  29.59 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  25.77 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  37.23 
 
 		 253 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  37.9 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  27.37 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  32.67 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  27 
 
 		 327 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  35.48 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  37.88 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  25.68 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>