More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1764 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  100 
 
 
123 aa  253  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  68.85 
 
 
124 aa  182  9e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  58.26 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  52 
 
 
133 aa  129  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  52.8 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  49.59 
 
 
129 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  47.97 
 
 
129 aa  120  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  53.1 
 
 
112 aa  114  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  54.65 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  54.65 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  50 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  41.23 
 
 
128 aa  90.5  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0951  glutamine synthetase repressor  37.84 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  50.79 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  35.23 
 
 
243 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 
243 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  35.23 
 
 
243 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
243 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  35.23 
 
 
243 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  35.23 
 
 
243 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
243 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  38.81 
 
 
243 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
243 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  38.81 
 
 
243 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
243 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
243 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  37.31 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
289 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 
150 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  34.34 
 
 
253 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  29.29 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
319 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  34.41 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
282 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  43.94 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0082  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  34.78 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0086  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  49.06 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  36.92 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  34.33 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  39.68 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  31.91 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  33.82 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
345 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  34.33 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  34.33 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  34.33 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  41.82 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0085  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1798  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0455207  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  33.85 
 
 
241 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  27.52 
 
 
242 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 
287 aa  47.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
295 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  32.58 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 
205 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
295 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  51.06 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
303 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 
114 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
98 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
242 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
311 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  31.31 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>