141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1319 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  30.47 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  27.94 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 247 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  27.21 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  29.5 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  38.16 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 133 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 206 aa  50.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  32.89 
 
 		 134 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  30.56 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  33.04 
 
 		 243 aa  50.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  27.85 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  28.24 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  25.36 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  26.52 
 
 		 264 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 122 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  31.82 
 
 		 122 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  28.8 
 
 		 206 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  29.6 
 
 		 198 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 246 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  25.61 
 
 		 246 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0901  putative MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  28.79 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  26.88 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  27.48 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  30.17 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0842  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.399496 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  30 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1160  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000138193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 241 aa  45.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 92 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  30.53 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  28.57 
 
 		 124 aa  44.7  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2106  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 101 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  27.87 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 129 aa  44.3  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  22.46 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 267 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  28 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>