51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0971 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  78.08 
 
 		 152 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  74.15 
 
 		 158 aa  237  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  48.97 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  48.97 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1160  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000138193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0901  putative MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 141 aa  127  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  53.39 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2226  hypothetical protein  44.74 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  38.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  29.23 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  36 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  27.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  28.17 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  37.84 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  34.94 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  27.27 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  36.71 
 
 		 243 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 198 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 199 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  38.57 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  34.67 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  34.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  30.49 
 
 		 201 aa  45.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  28.92 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  32.29 
 
 		 198 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 377 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>