65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3093 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  82.61 
 
 		 197 aa  296  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 198 aa  293  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  77.78 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  74.24 
 
 		 193 aa  281  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  67.65 
 
 		 198 aa  265  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  79.35 
 
 		 194 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  72.49 
 
 		 194 aa  257  8e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  73.89 
 
 		 206 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  68.5 
 
 		 203 aa  254  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  80.52 
 
 		 195 aa  250  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  80.24 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  77.5 
 
 		 200 aa  248  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  78.71 
 
 		 206 aa  241  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  71.67 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  66.84 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 234 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  61.73 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 204 aa  224  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  66.1 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  64.64 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  61.9 
 
 		 183 aa  222  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  60 
 
 		 225 aa  220  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  70.78 
 
 		 208 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  62.5 
 
 		 264 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  61.96 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  68.87 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  66.23 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  76.3 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  66.25 
 
 		 186 aa  205  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  70.92 
 
 		 188 aa  204  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  66.23 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  65.25 
 
 		 169 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  47.68 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  26.57 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  31.62 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 158 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 147 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  32.65 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0045  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 155 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 152 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.39 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 135 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  35.62 
 
 		 138 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 126 aa  42  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 149 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 128 aa  41.6  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 253 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 147 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 132 aa  41.2  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>