51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1397 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  68.95 
 
 		 203 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 198 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  64.5 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  65.56 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  66.1 
 
 		 193 aa  231  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  65.92 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  65.67 
 
 		 197 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  63.13 
 
 		 198 aa  225  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  69.28 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  65.9 
 
 		 194 aa  221  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  60.1 
 
 		 199 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  76.87 
 
 		 187 aa  215  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  65 
 
 		 198 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  71.72 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  62.42 
 
 		 180 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  63.35 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 206 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 206 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 206 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  64.6 
 
 		 190 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  56.99 
 
 		 189 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  62.8 
 
 		 188 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  62.99 
 
 		 205 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  70.15 
 
 		 218 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  56.18 
 
 		 183 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  62.99 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 208 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 186 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  65.69 
 
 		 188 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  63.97 
 
 		 169 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  45.8 
 
 		 201 aa  121  9e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  36.61 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  34.41 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 155 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  28.68 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 152 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.35 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 147 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>