63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1223 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  75.14 
 
 		 198 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  75.42 
 
 		 197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  77.84 
 
 		 193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  74.43 
 
 		 243 aa  258  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  70.88 
 
 		 206 aa  253  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  71.58 
 
 		 199 aa  252  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  71.43 
 
 		 198 aa  251  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  73.18 
 
 		 203 aa  248  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  78.05 
 
 		 194 aa  248  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  68.72 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 206 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 206 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 206 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  67.01 
 
 		 189 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  68.16 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  68.31 
 
 		 195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  68.51 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  68.21 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  69.44 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  69.27 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  67.23 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  67.55 
 
 		 194 aa  231  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  69.36 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  68.1 
 
 		 205 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  63.3 
 
 		 264 aa  228  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  66.67 
 
 		 198 aa  227  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  66.67 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  68.71 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  62.78 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  66.46 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  66.46 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  66.23 
 
 		 169 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  60.22 
 
 		 197 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  40.33 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  34.19 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  29.23 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  27.45 
 
 		 143 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  31.13 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 147 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 319 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  34.94 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 128 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 126 aa  42  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 260 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 132 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 158 aa  41.6  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  30 
 
 		 314 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0727  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 145 aa  41.2  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.24639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>