64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3972 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 144 aa  296  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  88.89 
 
 		 143 aa  220  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  88.89 
 
 		 143 aa  219  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2226  hypothetical protein  93.88 
 
 		 117 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1160  MerR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000138193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0901  putative MerR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 141 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  53.39 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  50.88 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  35.9 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  34.62 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  34.18 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  35.06 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  31.17 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  34.67 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 198 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 250 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 188 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  32.86 
 
 		 217 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  30.26 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  37.1 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  42  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 180 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  30.34 
 
 		 377 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  26.92 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  32.89 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 212 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 107 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>