87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14950 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  67.46 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  65.41 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  67.58 
 
 		 194 aa  228  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  63.59 
 
 		 197 aa  228  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  63.04 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  73.12 
 
 		 194 aa  228  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  64.61 
 
 		 206 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  65.7 
 
 		 198 aa  224  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  61.9 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  68.59 
 
 		 200 aa  221  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  64.97 
 
 		 203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  69.74 
 
 		 206 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  67.63 
 
 		 187 aa  219  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  63.39 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  68.79 
 
 		 195 aa  215  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  58.06 
 
 		 188 aa  214  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 206 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  58.56 
 
 		 189 aa  209  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 206 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  63.79 
 
 		 198 aa  207  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  60.45 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  73.88 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 208 aa  200  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  57.8 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  57.65 
 
 		 217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  66.67 
 
 		 205 aa  197  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  56.18 
 
 		 264 aa  194  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  63.46 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  61.94 
 
 		 169 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  58.14 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  36.07 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  37.61 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  30.43 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  39.51 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 148 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  36.9 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 132 aa  47.8  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 256 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 260 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  32.08 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 136 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 117 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  37.93 
 
 		 118 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 118 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 256 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 225 aa  41.2  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 118 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 135 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  38.71 
 
 		 132 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  39.34 
 
 		 315 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 254 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 249 aa  40.8  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>