38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4355 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  47.28 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  33.02 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  32.08 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  33.03 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  37.08 
 
 		 377 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  33.02 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  46 
 
 		 77 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  30.19 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  29.36 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  32.08 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  37.93 
 
 		 74 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  29.2 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  29.23 
 
 		 73 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  30.28 
 
 		 206 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 218 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  26.83 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  33.9 
 
 		 76 aa  41.6  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>