53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2772 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  91.35 
 
 		 205 aa  330  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  78.44 
 
 		 225 aa  325  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  79.9 
 
 		 234 aa  322  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  76.96 
 
 		 206 aa  320  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  76.96 
 
 		 206 aa  320  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  77.88 
 
 		 206 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  82.65 
 
 		 207 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  81.76 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  78.74 
 
 		 189 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  73.96 
 
 		 180 aa  261  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  70.88 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  68.39 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  66.48 
 
 		 198 aa  234  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  66.67 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  68.9 
 
 		 200 aa  228  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  62.5 
 
 		 243 aa  225  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  68.48 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 204 aa  221  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  68.99 
 
 		 194 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  61.34 
 
 		 187 aa  218  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  67.88 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  63.43 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  65.14 
 
 		 194 aa  211  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  63.33 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  65.62 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  66.67 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  64.38 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  57.46 
 
 		 183 aa  205  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  63.25 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  69.78 
 
 		 186 aa  201  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  69.06 
 
 		 188 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  65.58 
 
 		 169 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  61.44 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  42.76 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  31.68 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  32.46 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  29.67 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 152 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  29.36 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 154 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 158 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>