69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2379 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  91.57 
 
 		 186 aa  323  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  65.36 
 
 		 190 aa  228  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  70.3 
 
 		 180 aa  227  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  80.6 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  66.27 
 
 		 199 aa  217  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  63.58 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  67.27 
 
 		 188 aa  214  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  65.09 
 
 		 189 aa  214  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  61.85 
 
 		 198 aa  214  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  66.26 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 198 aa  212  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  67.9 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  64.67 
 
 		 243 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  64.85 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  67.52 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  63.03 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  63.03 
 
 		 207 aa  208  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  62.92 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  63.47 
 
 		 193 aa  208  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  59.89 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  67.11 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  62.09 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  63.91 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  66.26 
 
 		 203 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  59.78 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  69.06 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  65.45 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  69.06 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  70.8 
 
 		 206 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  68.15 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  60.61 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  58.6 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  43.7 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  28.37 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  27.74 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 143 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  36.14 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  27.69 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.34 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  28.7 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 135 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 155 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 138 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  32.84 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 98 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 128 aa  41.6  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 126 aa  41.2  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 142 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>