64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0472 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  59.35 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  43.3 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  46.59 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  45.4 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  47.26 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  44.63 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  48.3 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 		 195 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  47.95 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  46.39 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  46.9 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  48.65 
 
 		 199 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  48.63 
 
 		 180 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  51.15 
 
 		 218 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  45 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  41.62 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  49.25 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  46.75 
 
 		 169 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  40.62 
 
 		 183 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  49.26 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  43.31 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  47.33 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 377 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  31.88 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  24.73 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 143 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 144 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  28.7 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 129 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  27.96 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  31.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 130 aa  41.2  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1160  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000138193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>