58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_13820 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  370  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  80.79 
 
 
198 aa  275  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  79.35 
 
 
197 aa  274  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  76.97 
 
 
243 aa  268  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  73.66 
 
 
198 aa  266  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  74.44 
 
 
206 aa  262  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  77.71 
 
 
193 aa  259  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  83.54 
 
 
194 aa  258  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  76.34 
 
 
199 aa  254  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  74.3 
 
 
203 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  73.03 
 
 
194 aa  244  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  77.25 
 
 
195 aa  241  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  75 
 
 
206 aa  239  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  69.06 
 
 
190 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  70.35 
 
 
180 aa  237  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  69.44 
 
 
200 aa  234  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  68.33 
 
 
204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  70.86 
 
 
198 aa  231  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  68.39 
 
 
188 aa  229  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  65.34 
 
 
189 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  62.9 
 
 
234 aa  228  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  69.51 
 
 
264 aa  226  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  63.69 
 
 
206 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  63.69 
 
 
206 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  70.06 
 
 
208 aa  225  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  67.22 
 
 
183 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  63.69 
 
 
206 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  62.63 
 
 
225 aa  225  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  65.12 
 
 
207 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  72.78 
 
 
218 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  61.34 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  66.05 
 
 
205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  72.54 
 
 
186 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  64.81 
 
 
188 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  62.94 
 
 
197 aa  197  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  70.68 
 
 
169 aa  191  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
210 aa  164  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  44.38 
 
 
201 aa  137  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
212 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  28.57 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  34.55 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 
158 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 
377 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 
152 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  32 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  34.55 
 
 
202 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 
144 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
143 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 
143 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.56 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.43 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>