55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4007 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  76.14 
 
 		 188 aa  279  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  75.57 
 
 		 189 aa  275  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  72.32 
 
 		 207 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  73.14 
 
 		 206 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  73.14 
 
 		 206 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  73.14 
 
 		 206 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  72.57 
 
 		 234 aa  270  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  72.09 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  74.69 
 
 		 217 aa  253  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  72.84 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  73.12 
 
 		 190 aa  241  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  67.78 
 
 		 193 aa  239  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  72.67 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  67.8 
 
 		 243 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  67.6 
 
 		 203 aa  229  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  70.81 
 
 		 197 aa  227  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  70.12 
 
 		 198 aa  226  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  69.7 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  67.42 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  69.87 
 
 		 186 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  76.26 
 
 		 206 aa  222  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  63.54 
 
 		 198 aa  222  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  64.64 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  64.94 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  63.48 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  75.54 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  72.46 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  64.88 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  71.83 
 
 		 169 aa  210  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  62.42 
 
 		 264 aa  207  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  60.45 
 
 		 183 aa  206  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  59.48 
 
 		 197 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  45.93 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  29.7 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  39.51 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  32.23 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  30.59 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  32.53 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  28.69 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  31.13 
 
 		 202 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 147 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3972  putative transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 144 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2209  putative transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2272  putative transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  hitchhiker  0.000000767509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 129 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>