72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4225 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 
188 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
204 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 
218 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
200 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  42.75 
 
 
194 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  41.26 
 
 
193 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  39.16 
 
 
189 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  39.44 
 
 
183 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  43.65 
 
 
190 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  43.55 
 
 
188 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
186 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 
197 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 
169 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 
198 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  41.26 
 
 
187 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 
195 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
198 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
234 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
207 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  43.61 
 
 
194 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  39.16 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  38.41 
 
 
225 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  38.41 
 
 
217 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  36.96 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 
206 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
206 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
206 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
206 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  39.57 
 
 
199 aa  99  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  45.69 
 
 
243 aa  98.2  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  39.86 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  40.14 
 
 
198 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  40.98 
 
 
264 aa  92  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  29.32 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 
377 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  31.03 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
174 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  52 
 
 
129 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  29.73 
 
 
315 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 
121 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  27.59 
 
 
314 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 
152 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  28.87 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  29.05 
 
 
315 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  30.59 
 
 
148 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  39.34 
 
 
139 aa  46.2  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  48.94 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  31.21 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 
128 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  51.02 
 
 
67 aa  45.1  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
67 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
67 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  54.05 
 
 
98 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  56.41 
 
 
67 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0503  ATPase  29.3 
 
 
837 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  48.94 
 
 
145 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
132 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.86 
 
 
154 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3143  MerR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
135 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  43.86 
 
 
138 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  42  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 
272 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>