More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1127 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  98.8 
 
 
166 aa  321  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  98.8 
 
 
166 aa  320  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  95.78 
 
 
166 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  83.44 
 
 
179 aa  258  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  80.62 
 
 
166 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  83.55 
 
 
166 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  78.88 
 
 
166 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  82.55 
 
 
166 aa  236  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  82.55 
 
 
166 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  82.55 
 
 
166 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  70.73 
 
 
188 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  66.27 
 
 
183 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  34.91 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  42.59 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
315 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  54.41 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  37.78 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  50.82 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  50.77 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  44.3 
 
 
259 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  28.87 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 
124 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  37.23 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  28.89 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
132 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
92 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0537  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.400616  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 
254 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  31.17 
 
 
243 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  49.18 
 
 
126 aa  62  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
243 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2867  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  33.04 
 
 
243 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  33.04 
 
 
243 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
342 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
342 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  32.76 
 
 
243 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
342 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  52.31 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 
137 aa  60.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  32.76 
 
 
244 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 
334 aa  60.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
169 aa  60.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
131 aa  60.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  44.44 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  32.76 
 
 
244 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
295 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
258 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2106  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5725  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 
219 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.747282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  32.43 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
138 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  31.48 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
268 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
295 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  31.9 
 
 
243 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
241 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  31.9 
 
 
243 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
125 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  33.06 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  45.83 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  32.79 
 
 
133 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>