171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0727 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0727  transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  293  6e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.24639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1518  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0539  transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0878  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00904238  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0045  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1302  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  43.14 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 239 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 154 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.66 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  30.14 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 327 aa  47.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.93 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.93 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2183  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 268 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000038716  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  35.53 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  35 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  41.82 
 
 		 271 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  29.9 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  33.33 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  34.92 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  32.76 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  41.38 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.48 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2182  MerR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.565619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  31.67 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  37.7 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  40.68 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  29.51 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  40.68 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  30.77 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  29.27 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.43 
 
 		 154 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.43 
 
 		 154 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 99 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.43 
 
 		 154 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>