70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3574 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  54.64 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  58.89 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  58.14 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  55.21 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  55.81 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  53.01 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  54.76 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  50.55 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  52.38 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  44.68 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  33.71 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  41.56 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  33.65 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  37.33 
 
 		 319 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  35.63 
 
 		 319 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  31.18 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  31.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  29.79 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  32.94 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 302 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 389 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0727  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.24639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  31.11 
 
 		 123 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  35.63 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  30 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  36.11 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  28.89 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  27.91 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1058  transcriptional regulator, MerR family  27.72 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  45.24 
 
 		 212 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>