166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2000 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  43.75 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  43.54 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  43.75 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  43.27 
 
 		 222 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  39.42 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  36.92 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  36.92 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  38.58 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  36.59 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  33.17 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  33.17 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  37.95 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  37.95 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  37.95 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  37.95 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  37.31 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  37.82 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.15 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  32.52 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  32.52 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  32.69 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  32.04 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  32.21 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  32.21 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  31.34 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  31.34 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  31.73 
 
 		 244 aa  98.2  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  31.73 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  32.47 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  33 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  33 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  32.52 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  31.12 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  30.77 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  29.56 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  29 
 
 		 195 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  33.11 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  31.96 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  30.21 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  30.39 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  29.69 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  32.64 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  31.1 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  25.84 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  29.23 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  28.72 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  28.72 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  28.28 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  27.55 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  29.89 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  28.72 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  29.68 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  62 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  60 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  30.81 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  60 
 
 		 90 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  27.55 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  58 
 
 		 79 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  60 
 
 		 88 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  28.21 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  56.14 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  60 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  61.7 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  52.54 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  57.41 
 
 		 64 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  30.15 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  27.27 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  51.67 
 
 		 68 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  30.95 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  51.67 
 
 		 68 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  56 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  58.82 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  54.9 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  61.22 
 
 		 69 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  56.36 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  56.36 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  56.36 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  40.91 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  56.36 
 
 		 67 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  57.41 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  56 
 
 		 69 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  57.41 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  50.98 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  57.41 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  58.33 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  52.83 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  54 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  56 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>