63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2075 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 136 aa  270  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  84.31 
 
 		 108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  80.43 
 
 		 115 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  73.53 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  80.43 
 
 		 117 aa  154  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  71.13 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  70.65 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  60.71 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  55.21 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  50.94 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  45.12 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  37.04 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  34.74 
 
 		 195 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  35.16 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  39.74 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  36.9 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  42.62 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  37.08 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  36.9 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  33.75 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 302 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 129 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 129 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 129 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  35.06 
 
 		 143 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  36.07 
 
 		 241 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  30.68 
 
 		 183 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2183  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 268 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000038716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  31.03 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  34.12 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 146 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>