38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4878 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  92.59 
 
 		 115 aa  201  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  84.85 
 
 		 117 aa  170  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  73.53 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  72.82 
 
 		 108 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  70.79 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  70.97 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  51.04 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  50.55 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  45.05 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  35.16 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  32.99 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 243 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  32.93 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 283 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  37.18 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 157 aa  42.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 150 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 242 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  32.56 
 
 		 144 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 92 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  27 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 242 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  36.07 
 
 		 241 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 298 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>